Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
USP35Q9P2H5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
USP35Q9P2H5 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
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