Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
USP36Q9P275 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms