Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVK-5Q9HDB9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVK-5Q9HDB9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms