Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CYP4F12Q9HCS2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms