Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLMPQ9H6B4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms