Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0G0

ZNF407, Zinc finger protein 407, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407Q9C0G0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ZNF407Q9C0G0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF407Q9C0G0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF407Q9C0G0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF407Q9C0G0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ZNF407Q9C0G0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms