Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms