Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PLVAPQ9BX97 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PLVAPQ9BX97 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms