Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
PMCHL2Q9BQD1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms