Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS8Q99627 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms