Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DNAJA3Q96EY1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms