Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NMD3Q96D46 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms