Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SPTSSAQ969W0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SPTSSAQ969W0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SPTSSAQ969W0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SPTSSAQ969W0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SPTSSAQ969W0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SPTSSAQ969W0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SPTSSAQ969W0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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