Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CSNK2A3Q8NEV1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CSNK2A3Q8NEV1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CSNK2A3Q8NEV1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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CSNK2A3Q8NEV1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CSNK2A3Q8NEV1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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