Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms