Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVOPQ8N4V2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVOPQ8N4V2 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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