Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TREML1Q86YW5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML1Q86YW5 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML1Q86YW5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML1Q86YW5 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML1Q86YW5 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML1Q86YW5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML1Q86YW5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML1Q86YW5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML1Q86YW5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML1Q86YW5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML1Q86YW5 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML1Q86YW5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML1Q86YW5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML1Q86YW5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML1Q86YW5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML1Q86YW5 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML1Q86YW5 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML1Q86YW5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML1Q86YW5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML1Q86YW5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML1Q86YW5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML1Q86YW5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML1Q86YW5 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML1Q86YW5 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML1Q86YW5 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML1Q86YW5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML1Q86YW5 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TREML1Q86YW5 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms