Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHLHA9Q7RTU4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BHLHA9Q7RTU4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms