Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC174Q6PII3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms