Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LETMD1Q6P1Q0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms