Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ANKRD54Q6NXT1 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms