Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CARMIL2Q6F5E8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CARMIL2Q6F5E8 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms