Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD40Q6AI12 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms