Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PDSS1Q5T2R2 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms