Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BRMS1LQ5PSV4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms