Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ODF2Q5BJF6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ODF2Q5BJF6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms