Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TDRD12Q587J7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms