Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ANKRD39Q53RE8 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 RCAN1-214ENST00000620920 2257 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ANKRD39Q53RE8 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms