Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DUSP28Q4G0W2 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUSP28Q4G0W2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms