Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY52

ZIK1, Zinc finger protein interacting with ribonucleoprotein K, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIK1Q3SY52 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZIK1Q3SY52 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms