Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FHOD3Q2V2M9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms