Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MICAQ29983 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MICAQ29983 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MICAQ29983 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MICAQ29983 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MICAQ29983 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MICAQ29983 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MICAQ29983 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MICAQ29983 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MICAQ29983 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MICAQ29983 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MICAQ29983 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MICAQ29983 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MICAQ29983 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MICAQ29983 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms