Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UPP1Q16831 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
UPP1Q16831 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms