Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FXNQ16595 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FXNQ16595 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FXNQ16595 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FXNQ16595 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FXNQ16595 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FXNQ16595 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FXNQ16595 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FXNQ16595 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FXNQ16595 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FXNQ16595 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FXNQ16595 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FXNQ16595 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FXNQ16595 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FXNQ16595 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FXNQ16595 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FXNQ16595 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FXNQ16595 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FXNQ16595 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FXNQ16595 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FXNQ16595 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FXNQ16595 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FXNQ16595 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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