Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SSX1Q16384 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SSX1Q16384 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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SSX1Q16384 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SSX1Q16384 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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