Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC6Q16204 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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