Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GRIK4Q16099 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms