Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS72Q15906 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VPS72Q15906 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VPS72Q15906 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VPS72Q15906 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VPS72Q15906 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
VPS72Q15906 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VPS72Q15906 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VPS72Q15906 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VPS72Q15906 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
VPS72Q15906 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC21.32■■□□□ 1
VPS72Q15906 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
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