Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHRNA2Q15822 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
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