Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRADDQ15628 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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