Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IRF4Q15306 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms