Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCOLCEQ15113 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PCOLCEQ15113 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms