Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLCA4Q14CN2 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLCA4Q14CN2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131 ms