Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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COL19A1Q14993 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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COL19A1Q14993 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COL19A1Q14993 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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COL19A1Q14993 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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