Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NFIXQ14938 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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