Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KCNAB1Q14722 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms