Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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BECN1Q14457 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BECN1Q14457 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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BECN1Q14457 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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BECN1Q14457 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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BECN1Q14457 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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BECN1Q14457 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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BECN1Q14457 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BECN1Q14457 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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