Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM25Q14258 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms