Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDK13Q14004 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDK13Q14004 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
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