Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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KCNC3Q14003 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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KCNC3Q14003 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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KCNC3Q14003 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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KCNC3Q14003 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KCNC3Q14003 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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